Protein ID: 157412160 |
T4SS name [ID] | Tra_F [575] |
Gene symbol | trhG |
Locus tag | APECO1_O1R145 |
Strain | Escherichia coli APEC O1 |
Replicon | plasmid pAPEC-O1-R [GenBank: NC_009838] [Browse all T4SS(s) in this replicon] |
Location [Strand] | 162299..166252 [-] |
Product | inner membrane protein |
Component type | TraG_F |
UniProt ID | Q19ND7 |
KEGG ID | ecv:APECO1_O1R145 |
PDB ID | NA |
Domain hit(s) vs Pfam | TraG_N [PF07916], Evalue: 9.1e-77, Aligned region: 4..497 |
Protein Sequence: 1317 a.a. [Download] |
>gi|157412160|ref|YP_001481501.1| inner membrane protein [Escherichia coli APEC O1] MDYNIYTLGDIDFVWSAFTGIALIFSQYTGVKEFLTTAAVVAGVSLFYKTWLWLQAPTKNELPFFSWFLG LILFMMAMVRVDVTIESVKSGEVRNVDGIPIFIAAMATVTTNLSQGLLKDYKTAFDPLSPVDLSATTLDD DITLGPMIRFVKFLQWGGDSQGYCSAFPEPASGLGPMNVCATVQSLAYNCLKATQNSSANIAGKETIFND IFSANLADSMDRINQAMKGALKNASASIVGANGSKSGTCDEVWSTVKQVTSTAEARQTISLIGQTNGILT PDEANGAPTGASFTDVMASANGMYGKAIGSYDATLNLFIMNELRNGASKYKTPLGLASDMQLFEASLKRT NTMASQGQLWLQLSGAAIAFLEMFAYMVAPFALLMLLALGGNGVAAAAKYLQLILFVNMWPLTAVMVNAY VKKVATADLDTWSTLNSQNNAVTWMGLPGLAETYSSYLSVASALYALIPVLTLFLMTQSIHPMMNAVKGV TPDAPVDTGHVTPKVWDGPNSGKSSFGDVTRTALTSTGQGYSDGGAVDSSNFRLGMWNAGSSIANSQGQG SAVTSSVMSAASNSFQAGYSQMSEIGRSGQSSQQFSTNLQTMKQISDKIGASVAEGIATKHGVSASQMAS IASNVILNAGLNGGAGTGNGAGLKAAVAGQLSSGASKTNTGSDSLSNDLSKAITNQLSQDSALTDQFSKA ASQVSSDQISNTNAFKEASSKMNQATQTMAQNISTSVSTNASSNSGMSLDSKQSINLDRFSDSIRNKNFS DDDVRNFARKNGLDENAFMEKFNSYNDTFKASNQLGSQLQRTDALVAATRDFSEQKIAIDTARGETAESN KQDLRETSSLLKSLVSDFGGNAQQLLPITNQLDRISGDGSGINTITQAQDRTPDSVNTSGVMSASRVGEL GGSVDSQAKLGLSSNAQDATQRVPGKSEAGFTPYNLDNAGKGDIQGIHNNNVGRTYSDEERNVLNSLKTN GPVLNNQGVEKVVNSGQDVRNAEGTFNDLEKATGGRVVGDGMDQRATALNSMYQSGQVRGLSNNTDNYFS RVANNPNLSRDDKRAELAQQAVFTYGASTMATGAEREQLKADTQKILNELGNYNVNWSMNDVQSIHSSFN THNRADGSLESVVRANLGEGGSGGGLVGNRTQTVTDRLVGEKIEANTERGAISGALLGGQQFVSDTLTSV GAKPVNEMLTGAGILQTQTSIANDASNPANMPDSLQGKVLNHMQMSDGVAAVSDRYQSISSDGVSTYANA AQNSERAIRQQLTDDPRFGPQKADEFIQYMKSELSNTNEPYQSRVDKADQWLNENKR |
Nucleotide Sequence: 3954 bp [Download] |
>gi|157412014|ref|NC_009838.1|:c166252-162299 Escherichia coli APEC O1 plasmid pAPEC-O1-R, complete sequence ATGGATTACAACATATATACCCTGGGTGATATTGATTTTGTCTGGTCGGCTTTTACCGGTATTGCCCTAA TCTTTTCTCAATATACTGGTGTAAAAGAGTTCCTGACCACGGCCGCCGTTGTAGCAGGTGTGAGCCTATT CTATAAAACGTGGCTATGGCTTCAGGCTCCGACCAAAAATGAATTACCGTTTTTCTCCTGGTTTTTGGGG TTGATCCTTTTCATGATGGCAATGGTTCGAGTGGATGTAACTATTGAATCTGTAAAGTCGGGAGAGGTCA GAAACGTCGACGGAATTCCAATTTTTATTGCTGCGATGGCCACCGTCACCACTAACTTAAGCCAGGGTTT GCTGAAGGATTATAAAACTGCGTTTGATCCGCTTTCTCCGGTGGACCTGTCTGCAACAACTCTGGACGAT GACATCACCCTCGGTCCGATGATCCGATTCGTGAAGTTTTTGCAATGGGGCGGCGATAGCCAGGGCTACT GTTCTGCATTTCCTGAACCGGCCAGCGGGCTAGGGCCAATGAACGTATGTGCTACCGTTCAGTCTCTTGC ATACAACTGCCTGAAGGCTACCCAAAACTCAAGCGCAAATATTGCCGGTAAAGAAACTATTTTTAACGAT ATTTTCTCAGCTAATCTGGCAGATAGCATGGACCGGATTAATCAGGCGATGAAAGGCGCACTGAAGAATG CCTCTGCCAGTATTGTTGGCGCTAACGGTTCAAAATCTGGTACGTGTGATGAGGTCTGGTCAACTGTGAA ACAGGTTACCAGTACAGCTGAAGCTCGCCAGACTATTTCCCTTATAGGACAGACAAACGGCATCCTTACT CCAGACGAAGCAAATGGTGCACCTACCGGCGCAAGCTTTACTGATGTTATGGCGTCAGCAAATGGTATGT ACGGTAAGGCTATTGGTTCGTATGACGCCACCCTGAACCTGTTCATAATGAATGAGCTCAGAAATGGCGC AAGCAAATATAAGACCCCACTCGGTCTGGCTTCCGATATGCAGTTGTTTGAGGCTTCTCTGAAGCGAACC AACACAATGGCTTCACAGGGCCAGTTGTGGTTACAACTGTCGGGAGCAGCAATCGCATTCCTTGAAATGT TTGCTTATATGGTTGCTCCATTTGCTTTGCTTATGCTGCTGGCGTTAGGTGGTAATGGTGTTGCAGCTGC GGCGAAATATTTGCAACTTATCCTCTTCGTGAATATGTGGCCGCTTACGGCAGTAATGGTCAACGCGTAT GTGAAGAAAGTCGCGACGGCCGACTTGGATACCTGGAGCACCCTCAACAGCCAGAATAATGCCGTCACGT GGATGGGACTCCCAGGGCTTGCGGAAACATACAGTTCATACCTGTCTGTTGCTTCCGCCCTCTATGCTCT GATTCCGGTACTCACATTATTCCTGATGACACAGTCGATTCACCCGATGATGAATGCGGTTAAGGGAGTG ACCCCCGATGCGCCGGTGGATACTGGTCATGTAACGCCCAAAGTATGGGATGGCCCTAACAGCGGTAAAT CTTCATTTGGTGACGTGACACGAACCGCCTTAACCAGTACCGGTCAGGGATACAGCGATGGCGGCGCAGT TGATTCAAGTAATTTCCGTCTTGGAATGTGGAATGCTGGTTCAAGTATCGCTAACAGCCAGGGGCAAGGA TCAGCTGTAACCTCATCAGTTATGAGTGCGGCAAGTAATTCATTCCAGGCTGGTTACAGTCAGATGAGCG AAATTGGAAGGTCAGGACAGTCGAGCCAGCAGTTCTCAACCAACCTGCAAACAATGAAGCAGATCTCGGA TAAGATTGGTGCCTCTGTAGCAGAAGGTATTGCAACGAAACATGGGGTGAGTGCGTCTCAGATGGCCAGC ATTGCTTCAAATGTTATTCTCAACGCTGGGCTTAATGGAGGTGCTGGAACTGGCAATGGAGCCGGGCTGA AAGCGGCTGTAGCAGGGCAATTGAGTAGCGGTGCATCTAAGACCAATACAGGCAGTGACTCGCTTTCAAA TGACCTTTCAAAAGCAATCACGAATCAGCTTAGCCAGGATTCTGCGTTAACTGACCAGTTCAGTAAAGCG GCGTCTCAGGTAAGCAGCGATCAGATATCCAATACTAATGCGTTTAAAGAAGCATCGTCGAAAATGAACC AGGCGACACAGACGATGGCGCAAAATATTTCTACATCGGTTTCGACTAACGCAAGCTCCAATAGTGGAAT GAGCCTTGATTCTAAACAAAGCATTAACCTGGACAGGTTCTCCGATTCTATTCGCAACAAAAACTTCAGT GATGATGATGTAAGGAATTTTGCTCGTAAGAATGGGCTGGATGAGAATGCGTTTATGGAGAAATTCAACT CCTATAACGATACCTTCAAGGCCAGTAATCAGCTTGGATCGCAGCTTCAACGTACTGACGCGCTTGTGGC TGCAACACGAGATTTCAGTGAGCAAAAAATTGCGATTGATACCGCCCGGGGAGAGACGGCCGAAAGTAAT AAACAGGATCTCCGTGAAACCTCCAGCCTGCTTAAAAGTCTGGTTTCCGACTTCGGTGGTAATGCACAGC AGCTGCTACCTATCACCAATCAGCTCGACAGAATTTCAGGCGACGGGTCAGGAATTAATACTATCACTCA GGCACAGGATAGAACTCCTGACAGCGTAAATACGTCTGGCGTGATGAGTGCGTCACGCGTAGGGGAACTG GGTGGAAGTGTAGATTCGCAGGCTAAACTCGGTCTTTCCTCCAACGCTCAGGACGCGACACAGCGTGTCC CTGGAAAAAGTGAAGCTGGCTTTACTCCGTATAACCTTGATAACGCGGGCAAAGGCGATATTCAGGGAAT ACATAACAACAACGTGGGCCGCACTTATTCTGATGAAGAAAGGAATGTGCTCAATTCTCTCAAAACGAAT GGCCCTGTACTGAATAATCAGGGTGTAGAGAAAGTCGTCAATTCAGGTCAGGATGTCAGAAATGCAGAAG GCACATTTAACGATCTGGAAAAGGCTACCGGAGGTCGGGTGGTTGGTGATGGAATGGATCAACGAGCCAC TGCTTTGAACAGTATGTATCAGAGCGGTCAAGTTCGTGGCTTATCTAATAACACTGATAACTACTTTAGT CGTGTTGCCAACAACCCGAACTTAAGCCGGGACGATAAGCGAGCTGAATTGGCACAGCAAGCTGTCTTTA CCTATGGTGCCAGCACCATGGCTACCGGTGCCGAAAGAGAGCAGCTCAAAGCGGATACCCAGAAGATCCT TAATGAACTGGGTAACTATAACGTTAACTGGAGTATGAATGACGTTCAGAGCATCCATAGCAGTTTCAAC ACTCATAACAGAGCTGATGGTTCACTTGAGTCAGTCGTACGGGCAAACCTAGGAGAGGGTGGGTCGGGCG GTGGTCTCGTTGGTAACCGCACTCAGACCGTCACAGATCGCTTGGTTGGGGAAAAGATAGAGGCCAACAC TGAGCGGGGCGCGATTTCTGGTGCGCTACTCGGGGGCCAGCAATTTGTTTCGGATACGCTAACCAGCGTT GGGGCGAAACCGGTAAATGAGATGCTTACGGGAGCGGGCATCCTTCAAACCCAGACATCGATAGCAAATG ATGCCTCTAACCCTGCAAATATGCCTGATTCTCTCCAGGGTAAAGTCCTTAATCACATGCAGATGTCTGA TGGCGTCGCAGCTGTAAGTGACCGGTATCAGAGTATTAGCAGCGACGGCGTTTCGACTTATGCGAATGCA GCGCAGAACTCTGAAAGGGCTATCCGGCAGCAATTGACGGATGACCCACGCTTTGGGCCTCAGAAAGCAG ATGAATTCATTCAGTACATGAAGTCAGAGCTGAGCAACACAAATGAGCCTTACCAGTCACGTGTCGATAA AGCGGATCAGTGGCTTAATGAAAATAAAAGGTAG |