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In October, 2015, the BASE package developed by the SJTU-software team received a gold medal in iGEM 2015. Cogratulations!!!

The BASE, a web-based tool for biobrick evaluation, helping researchers build new devices and systems, is freely available at http://2015.igem.org/Team:SJTU-Software/home.


  SJTU-Software团队由生命科学技术学院、电子信息与电气工程学院、生物医学工程学院、媒体与设计学院的14名本科学生组成,由生命学院韦朝春、欧竑宇和陈峰共同担任指导老师。他们的参赛项目名为“BASE”,这个项目是对去年参赛队伍的项目“Easy BBK——An Easy Biobrick Blueprint's Package”的完善和发展,在继承了“Easy BBK”的主要功能,即整合了生物积块搜索引擎、画图以及上传功能之外,还对软件的功能进行了进一步的完善,并将整个系统以web应用的形式实现,使得系统的使用更为方便快捷。团队重新搭建起生物积块的数据库,在官方提供的数据源的基础上,加入生物积块更多的信息以衡量每一个生物积块在实验中的可靠程度,使得搜索引擎显示的结果能够按用户需求或生物积块的质量排序。团队设计的生物积块画图工具,不仅可以对智能指导生物积块的设计,还为未来生物积块的标准化表示提供了一种可能。同时,团队设计的上传工具可以直接通过在画图时将每个子生物积块的信息与数据库相连,使得上传生物积块的信息变得更简单高效。“BASE”将几个实用功能整合到一起,并以web应用的形式提供了方便的接入方式,给用户提供了一种非常完整的体验。这一软件设计引起了评委的极大兴趣,在海报讲解环节和现场答辩环节均获得了极高评价,希望能继续深入开发。


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